分析:分別把各點的坐標代入一次函數的解析式進行檢驗即可.
解答:解:A、∵當x=1時,y=(-3)×1=-3≠3,∴此點不在直線y=-3x上,故本選項錯誤;
B、∵當x=-1時,y=(-3)×(-1)=3≠-3,∴此點不在直線y=-3x上,故本選項錯誤;
C、∵當x=1時,y=(-3)×1=-3,∴此點在直線y=-3x上,故本選項正確;
D、∵當x=3時,y=(-3)×3=-9≠-1,∴此點不在直線y=-3x上,故本選項錯誤.
故選C.
點評:本題考查的是一次函數圖象上點的坐標特點,即一次函數圖象上各點的坐標一定適合此函數的解析式.