分析：A、原子核一般都由質子和中子構成．
B、構成物質的微粒有原子、分子與離子．
C、分子一定比構成該分子的原子大．
D、任何微粒都在不停地運動．
解答：解：A、原子核有質子中子構成，原子是由原子核與電子構成．故此選項錯誤．
B、構成物質的微粒有原子分子與離子，故此選項正確．
C、分子一定比構成該分子的原子大，分子不一定比構成該分子以外的原子大，故此選項錯誤．
D、任何微粒都在不停地運動，故此選項錯誤．
故選B
點評：此題是對分子原子的考查，解決的關鍵是能對分子與原子的知識有較全面的認識，屬常規性識記題．
