分析：根據酸的概念分析解決，酸在電離時陽離子全部是氫離子（H+），據此分析判斷即可；
解答：解：A、酸中都含有氫元素是酸的組成上的共性，但不是具有通性的原因，故錯誤；
B、由于酸電離時生成的陽離子全部是氫離子（H+），這是所有酸電離時的共性，所以酸的共性的實質是氫離子的性質，故正確．
C、酸都能使指示劑變色是酸的共性不是酸具有共性的原因，故錯誤；
D、酸都能跟活潑金屬反應是酸的共性不是酸具有共性的原因，故錯誤；
故選B
點評：本題主要考查了決定酸的性質的原因，可以依據酸的定義進行分析，屬基礎性知識考查題．
