①、因屬于同種元素的原子和離子，則質子數相同，故①錯誤；
②、因原子失去電子變為陽離子，Fe2+、Fe3+的電荷不同，則它們由原子變為離子時失去的電子不同，即它們的核外排布不同，故②正確；
③它們的最外層電子數不同，Fe的核外電子數等于核內質子數，Fe2+的核外電子數比核內質子數少2個，Fe3+的核外電子數比核內質子數少3個，故它們的最外層電子數不同，故③正確；
④、電子的質量很小，可忽略，則原子和離子的相對原子質量相同，說法正確，故④正確；
⑤、因Fe、Fe2+、Fe3+三種粒子的核外電子數不同，最外層電子數也不同，所以化學性質不同，說法錯誤；
⑥、它們都屬于同種元素，故⑥正確．
故②③④⑥正確．
故選C
